Protein–RNA interactions for Protein: P56749

CLDN12, Claudin-12, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN12P56749 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLDN12P56749 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLDN12P56749 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLDN12P56749 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLDN12P56749 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLDN12P56749 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN12P56749 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms