Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms