Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UTRNP46939 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UTRNP46939 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UTRNP46939 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UTRNP46939 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UTRNP46939 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
UTRNP46939 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UTRNP46939 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UTRNP46939 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UTRNP46939 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UTRNP46939 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UTRNP46939 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UTRNP46939 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
UTRNP46939 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UTRNP46939 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UTRNP46939 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UTRNP46939 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UTRNP46939 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UTRNP46939 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UTRNP46939 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UTRNP46939 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UTRNP46939 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UTRNP46939 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UTRNP46939 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UTRNP46939 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UTRNP46939 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UTRNP46939 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UTRNP46939 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UTRNP46939 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UTRNP46939 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UTRNP46939 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UTRNP46939 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UTRNP46939 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UTRNP46939 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UTRNP46939 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UTRNP46939 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UTRNP46939 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UTRNP46939 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UTRNP46939 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UTRNP46939 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UTRNP46939 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UTRNP46939 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
UTRNP46939 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UTRNP46939 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
UTRNP46939 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UTRNP46939 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UTRNP46939 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UTRNP46939 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UTRNP46939 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UTRNP46939 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
UTRNP46939 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UTRNP46939 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UTRNP46939 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UTRNP46939 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
UTRNP46939 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
UTRNP46939 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
UTRNP46939 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UTRNP46939 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UTRNP46939 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UTRNP46939 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UTRNP46939 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UTRNP46939 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UTRNP46939 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UTRNP46939 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
UTRNP46939 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UTRNP46939 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UTRNP46939 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UTRNP46939 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UTRNP46939 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UTRNP46939 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UTRNP46939 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UTRNP46939 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UTRNP46939 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UTRNP46939 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UTRNP46939 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UTRNP46939 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UTRNP46939 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UTRNP46939 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UTRNP46939 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UTRNP46939 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UTRNP46939 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
UTRNP46939 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UTRNP46939 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
UTRNP46939 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UTRNP46939 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UTRNP46939 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UTRNP46939 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
UTRNP46939 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UTRNP46939 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UTRNP46939 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UTRNP46939 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UTRNP46939 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UTRNP46939 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UTRNP46939 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UTRNP46939 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UTRNP46939 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UTRNP46939 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UTRNP46939 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UTRNP46939 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UTRNP46939 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms