Protein–RNA interactions for Protein: P43116

PTGER2, Prostaglandin E2 receptor EP2 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER2P43116 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTGER2P43116 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTGER2P43116 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTGER2P43116 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTGER2P43116 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PTGER2P43116 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTGER2P43116 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTGER2P43116 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTGER2P43116 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTGER2P43116 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTGER2P43116 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTGER2P43116 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTGER2P43116 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PTGER2P43116 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTGER2P43116 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTGER2P43116 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTGER2P43116 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTGER2P43116 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTGER2P43116 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTGER2P43116 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTGER2P43116 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTGER2P43116 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTGER2P43116 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTGER2P43116 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTGER2P43116 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTGER2P43116 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTGER2P43116 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTGER2P43116 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTGER2P43116 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTGER2P43116 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PTGER2P43116 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTGER2P43116 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PTGER2P43116 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTGER2P43116 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTGER2P43116 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTGER2P43116 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTGER2P43116 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTGER2P43116 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTGER2P43116 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTGER2P43116 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTGER2P43116 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTGER2P43116 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTGER2P43116 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTGER2P43116 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTGER2P43116 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTGER2P43116 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTGER2P43116 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTGER2P43116 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTGER2P43116 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTGER2P43116 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTGER2P43116 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTGER2P43116 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTGER2P43116 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTGER2P43116 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PTGER2P43116 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PTGER2P43116 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTGER2P43116 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTGER2P43116 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTGER2P43116 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTGER2P43116 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTGER2P43116 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTGER2P43116 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTGER2P43116 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTGER2P43116 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTGER2P43116 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTGER2P43116 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTGER2P43116 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTGER2P43116 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTGER2P43116 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTGER2P43116 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTGER2P43116 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTGER2P43116 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTGER2P43116 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTGER2P43116 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTGER2P43116 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTGER2P43116 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTGER2P43116 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTGER2P43116 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTGER2P43116 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTGER2P43116 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTGER2P43116 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTGER2P43116 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTGER2P43116 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTGER2P43116 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTGER2P43116 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTGER2P43116 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PTGER2P43116 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTGER2P43116 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTGER2P43116 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTGER2P43116 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTGER2P43116 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PTGER2P43116 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTGER2P43116 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTGER2P43116 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTGER2P43116 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTGER2P43116 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTGER2P43116 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PTGER2P43116 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTGER2P43116 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTGER2P43116 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms