Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KDM5CP41229 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KDM5CP41229 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
KDM5CP41229 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KDM5CP41229 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KDM5CP41229 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KDM5CP41229 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KDM5CP41229 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KDM5CP41229 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KDM5CP41229 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KDM5CP41229 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KDM5CP41229 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
KDM5CP41229 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
KDM5CP41229 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
KDM5CP41229 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KDM5CP41229 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KDM5CP41229 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KDM5CP41229 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
KDM5CP41229 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KDM5CP41229 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KDM5CP41229 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KDM5CP41229 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KDM5CP41229 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KDM5CP41229 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KDM5CP41229 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KDM5CP41229 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KDM5CP41229 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
KDM5CP41229 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
KDM5CP41229 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KDM5CP41229 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KDM5CP41229 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KDM5CP41229 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KDM5CP41229 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KDM5CP41229 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KDM5CP41229 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KDM5CP41229 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KDM5CP41229 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KDM5CP41229 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KDM5CP41229 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KDM5CP41229 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KDM5CP41229 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KDM5CP41229 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
KDM5CP41229 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KDM5CP41229 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KDM5CP41229 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
KDM5CP41229 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KDM5CP41229 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KDM5CP41229 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
KDM5CP41229 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KDM5CP41229 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KDM5CP41229 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KDM5CP41229 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
KDM5CP41229 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
KDM5CP41229 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
KDM5CP41229 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
KDM5CP41229 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
KDM5CP41229 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
KDM5CP41229 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
KDM5CP41229 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
KDM5CP41229 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
KDM5CP41229 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KDM5CP41229 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KDM5CP41229 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
KDM5CP41229 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
KDM5CP41229 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
KDM5CP41229 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
KDM5CP41229 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
KDM5CP41229 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
KDM5CP41229 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
KDM5CP41229 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KDM5CP41229 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KDM5CP41229 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KDM5CP41229 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KDM5CP41229 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KDM5CP41229 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KDM5CP41229 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
KDM5CP41229 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KDM5CP41229 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KDM5CP41229 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KDM5CP41229 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KDM5CP41229 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KDM5CP41229 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KDM5CP41229 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KDM5CP41229 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
KDM5CP41229 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KDM5CP41229 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KDM5CP41229 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
KDM5CP41229 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
KDM5CP41229 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
KDM5CP41229 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
KDM5CP41229 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KDM5CP41229 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
KDM5CP41229 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KDM5CP41229 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KDM5CP41229 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KDM5CP41229 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KDM5CP41229 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KDM5CP41229 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KDM5CP41229 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KDM5CP41229 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms