Protein–RNA interactions for Protein: P41219

PRPH, Peripherin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPHP41219 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPHP41219 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPHP41219 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPHP41219 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPHP41219 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPHP41219 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPHP41219 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPHP41219 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPHP41219 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPHP41219 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPHP41219 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPHP41219 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPHP41219 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPHP41219 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPHP41219 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPHP41219 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRPHP41219 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRPHP41219 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRPHP41219 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRPHP41219 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPHP41219 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPHP41219 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPHP41219 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPHP41219 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPHP41219 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPHP41219 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPHP41219 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPHP41219 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPHP41219 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPHP41219 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPHP41219 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPHP41219 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPHP41219 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPHP41219 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPHP41219 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPHP41219 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPHP41219 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPHP41219 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPHP41219 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPHP41219 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPHP41219 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPHP41219 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPHP41219 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPHP41219 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPHP41219 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPHP41219 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPHP41219 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPHP41219 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPHP41219 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPHP41219 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPHP41219 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPHP41219 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPHP41219 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPHP41219 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPHP41219 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPHP41219 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPHP41219 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPHP41219 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPHP41219 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPHP41219 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPHP41219 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPHP41219 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPHP41219 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPHP41219 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPHP41219 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPHP41219 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPHP41219 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPHP41219 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPHP41219 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPHP41219 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPHP41219 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPHP41219 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPHP41219 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPHP41219 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPHP41219 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPHP41219 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPHP41219 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPHP41219 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPHP41219 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPHP41219 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPHP41219 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPHP41219 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPHP41219 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPHP41219 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPHP41219 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPHP41219 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPHP41219 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPHP41219 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPHP41219 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPHP41219 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPHP41219 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPHP41219 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPHP41219 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPHP41219 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPHP41219 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPHP41219 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPHP41219 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPHP41219 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPHP41219 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPHP41219 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms