Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTGFP29279 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTGFP29279 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTGFP29279 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTGFP29279 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTGFP29279 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CTGFP29279 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTGFP29279 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTGFP29279 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTGFP29279 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTGFP29279 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CTGFP29279 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTGFP29279 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTGFP29279 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTGFP29279 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTGFP29279 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTGFP29279 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTGFP29279 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTGFP29279 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTGFP29279 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTGFP29279 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTGFP29279 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTGFP29279 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTGFP29279 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CTGFP29279 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTGFP29279 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTGFP29279 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTGFP29279 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CTGFP29279 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTGFP29279 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTGFP29279 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTGFP29279 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTGFP29279 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTGFP29279 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CTGFP29279 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CTGFP29279 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTGFP29279 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTGFP29279 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTGFP29279 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CTGFP29279 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTGFP29279 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTGFP29279 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTGFP29279 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTGFP29279 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTGFP29279 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTGFP29279 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTGFP29279 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTGFP29279 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTGFP29279 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTGFP29279 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTGFP29279 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTGFP29279 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTGFP29279 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTGFP29279 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTGFP29279 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTGFP29279 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTGFP29279 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTGFP29279 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTGFP29279 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTGFP29279 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTGFP29279 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTGFP29279 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTGFP29279 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTGFP29279 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTGFP29279 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTGFP29279 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTGFP29279 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTGFP29279 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTGFP29279 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTGFP29279 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTGFP29279 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTGFP29279 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTGFP29279 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CTGFP29279 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTGFP29279 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CTGFP29279 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTGFP29279 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTGFP29279 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTGFP29279 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTGFP29279 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTGFP29279 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTGFP29279 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTGFP29279 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTGFP29279 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTGFP29279 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTGFP29279 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTGFP29279 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CTGFP29279 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTGFP29279 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTGFP29279 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTGFP29279 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTGFP29279 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTGFP29279 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTGFP29279 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CTGFP29279 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTGFP29279 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CTGFP29279 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CTGFP29279 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTGFP29279 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CTGFP29279 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms