Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

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Length 629 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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