Protein–RNA interactions for Protein: P11597

CETP, Cholesteryl ester transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CETPP11597 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CETPP11597 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CETPP11597 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CETPP11597 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CETPP11597 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CETPP11597 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CETPP11597 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CETPP11597 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CETPP11597 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CETPP11597 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CETPP11597 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CETPP11597 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CETPP11597 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CETPP11597 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CETPP11597 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CETPP11597 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CETPP11597 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CETPP11597 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CETPP11597 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CETPP11597 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CETPP11597 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CETPP11597 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CETPP11597 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CETPP11597 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CETPP11597 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CETPP11597 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CETPP11597 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CETPP11597 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CETPP11597 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CETPP11597 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CETPP11597 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CETPP11597 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CETPP11597 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CETPP11597 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CETPP11597 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CETPP11597 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CETPP11597 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CETPP11597 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CETPP11597 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CETPP11597 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CETPP11597 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CETPP11597 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CETPP11597 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CETPP11597 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CETPP11597 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CETPP11597 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CETPP11597 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CETPP11597 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CETPP11597 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CETPP11597 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CETPP11597 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CETPP11597 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CETPP11597 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CETPP11597 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CETPP11597 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CETPP11597 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CETPP11597 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CETPP11597 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CETPP11597 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CETPP11597 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CETPP11597 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CETPP11597 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CETPP11597 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CETPP11597 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CETPP11597 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CETPP11597 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CETPP11597 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CETPP11597 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CETPP11597 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CETPP11597 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CETPP11597 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CETPP11597 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CETPP11597 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CETPP11597 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CETPP11597 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CETPP11597 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CETPP11597 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CETPP11597 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CETPP11597 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CETPP11597 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CETPP11597 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CETPP11597 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CETPP11597 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CETPP11597 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CETPP11597 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CETPP11597 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CETPP11597 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CETPP11597 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CETPP11597 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CETPP11597 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CETPP11597 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CETPP11597 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CETPP11597 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CETPP11597 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CETPP11597 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CETPP11597 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CETPP11597 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CETPP11597 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CETPP11597 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CETPP11597 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms