Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMIM10L2BP0DMW5 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMIM10L2BP0DMW5 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SMIM10L2BP0DMW5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMIM10L2BP0DMW5 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMIM10L2BP0DMW5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMIM10L2BP0DMW5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMIM10L2BP0DMW5 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMIM10L2BP0DMW5 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMIM10L2BP0DMW5 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMIM10L2BP0DMW5 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SMIM10L2BP0DMW5 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMIM10L2BP0DMW5 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMIM10L2BP0DMW5 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMIM10L2BP0DMW5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMIM10L2BP0DMW5 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMIM10L2BP0DMW5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMIM10L2BP0DMW5 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMIM10L2BP0DMW5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMIM10L2BP0DMW5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMIM10L2BP0DMW5 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMIM10L2BP0DMW5 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMIM10L2BP0DMW5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM10L2BP0DMW5 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM10L2BP0DMW5 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM10L2BP0DMW5 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM10L2BP0DMW5 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM10L2BP0DMW5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM10L2BP0DMW5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM10L2BP0DMW5 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM10L2BP0DMW5 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM10L2BP0DMW5 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM10L2BP0DMW5 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM10L2BP0DMW5 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM10L2BP0DMW5 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM10L2BP0DMW5 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM10L2BP0DMW5 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM10L2BP0DMW5 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM10L2BP0DMW5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM10L2BP0DMW5 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM10L2BP0DMW5 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM10L2BP0DMW5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM10L2BP0DMW5 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM10L2BP0DMW5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM10L2BP0DMW5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM10L2BP0DMW5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMIM10L2BP0DMW5 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SMIM10L2BP0DMW5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMIM10L2BP0DMW5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMIM10L2BP0DMW5 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMIM10L2BP0DMW5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMIM10L2BP0DMW5 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMIM10L2BP0DMW5 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMIM10L2BP0DMW5 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMIM10L2BP0DMW5 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMIM10L2BP0DMW5 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMIM10L2BP0DMW5 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMIM10L2BP0DMW5 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMIM10L2BP0DMW5 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMIM10L2BP0DMW5 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMIM10L2BP0DMW5 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMIM10L2BP0DMW5 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMIM10L2BP0DMW5 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMIM10L2BP0DMW5 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SMIM10L2BP0DMW5 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMIM10L2BP0DMW5 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMIM10L2BP0DMW5 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMIM10L2BP0DMW5 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMIM10L2BP0DMW5 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMIM10L2BP0DMW5 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMIM10L2BP0DMW5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMIM10L2BP0DMW5 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMIM10L2BP0DMW5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMIM10L2BP0DMW5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMIM10L2BP0DMW5 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMIM10L2BP0DMW5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMIM10L2BP0DMW5 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMIM10L2BP0DMW5 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMIM10L2BP0DMW5 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMIM10L2BP0DMW5 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMIM10L2BP0DMW5 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMIM10L2BP0DMW5 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMIM10L2BP0DMW5 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMIM10L2BP0DMW5 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMIM10L2BP0DMW5 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMIM10L2BP0DMW5 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SMIM10L2BP0DMW5 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMIM10L2BP0DMW5 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMIM10L2BP0DMW5 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMIM10L2BP0DMW5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMIM10L2BP0DMW5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMIM10L2BP0DMW5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SMIM10L2BP0DMW5 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMIM10L2BP0DMW5 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMIM10L2BP0DMW5 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SMIM10L2BP0DMW5 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms