Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW4

SMIM10L2A, Small integral membrane protein 10-like protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2AP0DMW4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMIM10L2AP0DMW4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMIM10L2AP0DMW4 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SMIM10L2AP0DMW4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMIM10L2AP0DMW4 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMIM10L2AP0DMW4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMIM10L2AP0DMW4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMIM10L2AP0DMW4 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMIM10L2AP0DMW4 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMIM10L2AP0DMW4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMIM10L2AP0DMW4 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SMIM10L2AP0DMW4 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMIM10L2AP0DMW4 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMIM10L2AP0DMW4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMIM10L2AP0DMW4 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMIM10L2AP0DMW4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMIM10L2AP0DMW4 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMIM10L2AP0DMW4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMIM10L2AP0DMW4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMIM10L2AP0DMW4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMIM10L2AP0DMW4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMIM10L2AP0DMW4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMIM10L2AP0DMW4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMIM10L2AP0DMW4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM10L2AP0DMW4 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM10L2AP0DMW4 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM10L2AP0DMW4 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM10L2AP0DMW4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM10L2AP0DMW4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM10L2AP0DMW4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM10L2AP0DMW4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM10L2AP0DMW4 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM10L2AP0DMW4 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM10L2AP0DMW4 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM10L2AP0DMW4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM10L2AP0DMW4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM10L2AP0DMW4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM10L2AP0DMW4 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM10L2AP0DMW4 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM10L2AP0DMW4 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM10L2AP0DMW4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM10L2AP0DMW4 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM10L2AP0DMW4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM10L2AP0DMW4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM10L2AP0DMW4 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM10L2AP0DMW4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM10L2AP0DMW4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM10L2AP0DMW4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMIM10L2AP0DMW4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SMIM10L2AP0DMW4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMIM10L2AP0DMW4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMIM10L2AP0DMW4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMIM10L2AP0DMW4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMIM10L2AP0DMW4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMIM10L2AP0DMW4 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMIM10L2AP0DMW4 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMIM10L2AP0DMW4 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMIM10L2AP0DMW4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMIM10L2AP0DMW4 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMIM10L2AP0DMW4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms