Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGB3P05106 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITGB3P05106 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITGB3P05106 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITGB3P05106 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITGB3P05106 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGB3P05106 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGB3P05106 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGB3P05106 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGB3P05106 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGB3P05106 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGB3P05106 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGB3P05106 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGB3P05106 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGB3P05106 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGB3P05106 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGB3P05106 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGB3P05106 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGB3P05106 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGB3P05106 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGB3P05106 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGB3P05106 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGB3P05106 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGB3P05106 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGB3P05106 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGB3P05106 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGB3P05106 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGB3P05106 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGB3P05106 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGB3P05106 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGB3P05106 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGB3P05106 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGB3P05106 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGB3P05106 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGB3P05106 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGB3P05106 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGB3P05106 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGB3P05106 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGB3P05106 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGB3P05106 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGB3P05106 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGB3P05106 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGB3P05106 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGB3P05106 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGB3P05106 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGB3P05106 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGB3P05106 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGB3P05106 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGB3P05106 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGB3P05106 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGB3P05106 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGB3P05106 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGB3P05106 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGB3P05106 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGB3P05106 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGB3P05106 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGB3P05106 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGB3P05106 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGB3P05106 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGB3P05106 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGB3P05106 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGB3P05106 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGB3P05106 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGB3P05106 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGB3P05106 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGB3P05106 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGB3P05106 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGB3P05106 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGB3P05106 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGB3P05106 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGB3P05106 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGB3P05106 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGB3P05106 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGB3P05106 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGB3P05106 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms