Protein–RNA interactions for Protein: P02458

COL2A1, Collagen alpha-1(II) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL2A1P02458 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL2A1P02458 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL2A1P02458 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL2A1P02458 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL2A1P02458 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL2A1P02458 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL2A1P02458 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL2A1P02458 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL2A1P02458 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL2A1P02458 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL2A1P02458 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL2A1P02458 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL2A1P02458 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL2A1P02458 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL2A1P02458 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL2A1P02458 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL2A1P02458 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL2A1P02458 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL2A1P02458 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL2A1P02458 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL2A1P02458 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL2A1P02458 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL2A1P02458 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL2A1P02458 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL2A1P02458 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL2A1P02458 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
COL2A1P02458 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL2A1P02458 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
COL2A1P02458 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL2A1P02458 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL2A1P02458 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL2A1P02458 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
COL2A1P02458 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
COL2A1P02458 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL2A1P02458 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL2A1P02458 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL2A1P02458 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL2A1P02458 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL2A1P02458 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL2A1P02458 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL2A1P02458 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
COL2A1P02458 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL2A1P02458 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
COL2A1P02458 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL2A1P02458 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL2A1P02458 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL2A1P02458 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL2A1P02458 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL2A1P02458 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL2A1P02458 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
COL2A1P02458 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL2A1P02458 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL2A1P02458 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL2A1P02458 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL2A1P02458 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL2A1P02458 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL2A1P02458 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
COL2A1P02458 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
COL2A1P02458 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL2A1P02458 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL2A1P02458 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL2A1P02458 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL2A1P02458 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL2A1P02458 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL2A1P02458 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL2A1P02458 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL2A1P02458 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL2A1P02458 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL2A1P02458 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL2A1P02458 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL2A1P02458 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL2A1P02458 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL2A1P02458 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL2A1P02458 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL2A1P02458 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL2A1P02458 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
COL2A1P02458 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL2A1P02458 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL2A1P02458 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
COL2A1P02458 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL2A1P02458 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL2A1P02458 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL2A1P02458 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL2A1P02458 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
COL2A1P02458 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL2A1P02458 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL2A1P02458 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL2A1P02458 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL2A1P02458 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
COL2A1P02458 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL2A1P02458 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL2A1P02458 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL2A1P02458 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL2A1P02458 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL2A1P02458 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL2A1P02458 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
COL2A1P02458 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL2A1P02458 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL2A1P02458 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL2A1P02458 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms