Protein–RNA interactions for Protein: O75683

SURF6, Surfeit locus protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF6O75683 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SURF6O75683 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SURF6O75683 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SURF6O75683 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SURF6O75683 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SURF6O75683 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SURF6O75683 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SURF6O75683 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SURF6O75683 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SURF6O75683 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SURF6O75683 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SURF6O75683 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SURF6O75683 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SURF6O75683 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SURF6O75683 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SURF6O75683 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SURF6O75683 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SURF6O75683 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SURF6O75683 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SURF6O75683 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SURF6O75683 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SURF6O75683 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SURF6O75683 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SURF6O75683 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SURF6O75683 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SURF6O75683 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SURF6O75683 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SURF6O75683 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SURF6O75683 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SURF6O75683 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SURF6O75683 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SURF6O75683 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SURF6O75683 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SURF6O75683 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SURF6O75683 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SURF6O75683 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SURF6O75683 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SURF6O75683 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SURF6O75683 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SURF6O75683 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SURF6O75683 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SURF6O75683 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SURF6O75683 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SURF6O75683 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SURF6O75683 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SURF6O75683 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SURF6O75683 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SURF6O75683 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SURF6O75683 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SURF6O75683 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SURF6O75683 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SURF6O75683 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SURF6O75683 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SURF6O75683 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SURF6O75683 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SURF6O75683 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SURF6O75683 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SURF6O75683 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SURF6O75683 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SURF6O75683 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SURF6O75683 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SURF6O75683 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SURF6O75683 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SURF6O75683 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SURF6O75683 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SURF6O75683 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SURF6O75683 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SURF6O75683 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SURF6O75683 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SURF6O75683 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SURF6O75683 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SURF6O75683 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SURF6O75683 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SURF6O75683 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SURF6O75683 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SURF6O75683 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SURF6O75683 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SURF6O75683 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SURF6O75683 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SURF6O75683 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SURF6O75683 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SURF6O75683 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SURF6O75683 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SURF6O75683 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SURF6O75683 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SURF6O75683 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SURF6O75683 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SURF6O75683 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SURF6O75683 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SURF6O75683 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SURF6O75683 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SURF6O75683 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SURF6O75683 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SURF6O75683 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SURF6O75683 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SURF6O75683 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SURF6O75683 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SURF6O75683 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SURF6O75683 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SURF6O75683 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms