Protein–RNA interactions for Protein: O60524

NEMF, Nuclear export mediator factor NEMF, humanhuman

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMFO60524 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEMFO60524 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEMFO60524 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEMFO60524 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEMFO60524 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEMFO60524 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEMFO60524 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEMFO60524 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEMFO60524 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEMFO60524 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NEMFO60524 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEMFO60524 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEMFO60524 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEMFO60524 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEMFO60524 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NEMFO60524 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEMFO60524 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEMFO60524 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEMFO60524 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEMFO60524 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEMFO60524 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEMFO60524 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEMFO60524 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEMFO60524 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEMFO60524 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NEMFO60524 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEMFO60524 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEMFO60524 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEMFO60524 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEMFO60524 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEMFO60524 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEMFO60524 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEMFO60524 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEMFO60524 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEMFO60524 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEMFO60524 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEMFO60524 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NEMFO60524 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NEMFO60524 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEMFO60524 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEMFO60524 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEMFO60524 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEMFO60524 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEMFO60524 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEMFO60524 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEMFO60524 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEMFO60524 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEMFO60524 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEMFO60524 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEMFO60524 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEMFO60524 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEMFO60524 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEMFO60524 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEMFO60524 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEMFO60524 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEMFO60524 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NEMFO60524 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEMFO60524 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEMFO60524 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEMFO60524 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEMFO60524 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEMFO60524 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NEMFO60524 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEMFO60524 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEMFO60524 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEMFO60524 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NEMFO60524 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEMFO60524 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEMFO60524 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NEMFO60524 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NEMFO60524 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEMFO60524 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEMFO60524 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEMFO60524 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEMFO60524 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEMFO60524 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEMFO60524 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEMFO60524 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEMFO60524 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEMFO60524 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEMFO60524 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEMFO60524 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEMFO60524 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEMFO60524 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEMFO60524 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEMFO60524 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEMFO60524 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEMFO60524 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEMFO60524 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEMFO60524 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEMFO60524 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEMFO60524 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEMFO60524 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEMFO60524 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEMFO60524 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NEMFO60524 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEMFO60524 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEMFO60524 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEMFO60524 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEMFO60524 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms