Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PPLO60437 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PPLO60437 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PPLO60437 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PPLO60437 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PPLO60437 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PPLO60437 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PPLO60437 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PPLO60437 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PPLO60437 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPLO60437 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPLO60437 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPLO60437 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPLO60437 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPLO60437 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPLO60437 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPLO60437 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPLO60437 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPLO60437 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPLO60437 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPLO60437 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPLO60437 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPLO60437 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPLO60437 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPLO60437 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPLO60437 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPLO60437 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPLO60437 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPLO60437 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPLO60437 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PPLO60437 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPLO60437 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPLO60437 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PPLO60437 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PPLO60437 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PPLO60437 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PPLO60437 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PPLO60437 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PPLO60437 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PPLO60437 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PPLO60437 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PPLO60437 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PPLO60437 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PPLO60437 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PPLO60437 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PPLO60437 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PPLO60437 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PPLO60437 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PPLO60437 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PPLO60437 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PPLO60437 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PPLO60437 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PPLO60437 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PPLO60437 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PPLO60437 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PPLO60437 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PPLO60437 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PPLO60437 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PPLO60437 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PPLO60437 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PPLO60437 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PPLO60437 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PPLO60437 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PPLO60437 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PPLO60437 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PPLO60437 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PPLO60437 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PPLO60437 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PPLO60437 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPLO60437 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPLO60437 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPLO60437 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPLO60437 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPLO60437 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPLO60437 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPLO60437 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PPLO60437 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPLO60437 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPLO60437 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPLO60437 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPLO60437 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPLO60437 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPLO60437 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PPLO60437 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPLO60437 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPLO60437 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPLO60437 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PPLO60437 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPLO60437 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPLO60437 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPLO60437 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPLO60437 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPLO60437 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPLO60437 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPLO60437 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPLO60437 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPLO60437 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPLO60437 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPLO60437 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPLO60437 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms