Protein–RNA interactions for Protein: B4E171

Tetraspanin, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E171 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
B4E171 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
B4E171 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
B4E171 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
B4E171 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
B4E171 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
B4E171 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
B4E171 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
B4E171 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
B4E171 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
B4E171 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4E171 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4E171 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4E171 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4E171 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4E171 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4E171 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4E171 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4E171 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4E171 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4E171 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4E171 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4E171 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4E171 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4E171 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4E171 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4E171 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4E171 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4E171 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4E171 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4E171 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4E171 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4E171 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4E171 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4E171 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4E171 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4E171 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4E171 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4E171 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
B4E171 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
B4E171 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4E171 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4E171 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4E171 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4E171 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4E171 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4E171 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4E171 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
B4E171 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
B4E171 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
B4E171 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
B4E171 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
B4E171 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
B4E171 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
B4E171 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
B4E171 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
B4E171 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
B4E171 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
B4E171 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
B4E171 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
B4E171 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
B4E171 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
B4E171 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
B4E171 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
B4E171 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
B4E171 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
B4E171 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
B4E171 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
B4E171 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
B4E171 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
B4E171 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
B4E171 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
B4E171 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
B4E171 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
B4E171 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
B4E171 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
B4E171 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
B4E171 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
B4E171 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
B4E171 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
B4E171 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
B4E171 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
B4E171 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
B4E171 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
B4E171 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
B4E171 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
B4E171 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
B4E171 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
B4E171 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
B4E171 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
B4E171 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
B4E171 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
B4E171 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
B4E171 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
B4E171 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
B4E171 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
B4E171 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
B4E171 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
B4E171 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4E171 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms