Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms