Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms