Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 AL353148.1-202ENST00000424701 551 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 LINC01831-201ENST00000449772 493 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 AP000662.1-201ENST00000530952 487 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 AC127526.3-201ENST00000534291 450 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 AC069366.1-201ENST00000583159 838 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 DICER1-201ENST00000343455 10277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 ZNF714-202ENST00000456283 6812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 CACNA2D3-212ENST00000620722 3296 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 AP001636.3-201ENST00000533954 2810 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 SLC39A12-202ENST00000377371 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 RAI14-228ENST00000515799 3486 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 RAB9B-201ENST00000243298 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 KMT2C-201ENST00000262189 16862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 KMT2C-202ENST00000355193 16858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 SLC30A6-201ENST00000282587 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 CYP3A5-202ENST00000339843 3320 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 MME-203ENST00000460393 5622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 FREM2-201ENST00000280481 16070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 EOGT-201ENST00000295571 4138 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 AC020765.1-201ENST00000604296 328 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 AC010168.2-201ENST00000562691 5428 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 ANO4-201ENST00000392977 3509 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 ENTPD1-205ENST00000453258 5044 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 UNC13B-209ENST00000635942 14550 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 SYT4-201ENST00000255224 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 OR56B1-201ENST00000317121 2075 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 548.4 ms