Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 KIAA1549L-202ENST00000321505 11678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP1Q9C000 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP1Q9C000 SMCO1-201ENST00000397537 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP1Q9C000 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP1Q9C000 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP1Q9C000 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP1Q9C000 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP1Q9C000 NFATC3-201ENST00000329524 6144 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP1Q9C000 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP1Q9C000 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP1Q9C000 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP1Q9C000 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP1Q9C000 POGZ-204ENST00000392723 6152 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP1Q9C000 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP1Q9C000 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP1Q9C000 AC066595.1-201ENST00000426697 399 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP1Q9C000 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP1Q9C000 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP1Q9C000 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP1Q9C000 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP1Q9C000 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP1Q9C000 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP1Q9C000 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP1Q9C000 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP1Q9C000 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP1Q9C000 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP1Q9C000 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP1Q9C000 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP1Q9C000 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP1Q9C000 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP1Q9C000 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP1Q9C000 AL161756.1-201ENST00000555861 1751 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP1Q9C000 BTRC-204ENST00000408038 5982 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
NLRP1Q9C000 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
NLRP1Q9C000 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NLRP1Q9C000 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NLRP1Q9C000 MYO6-202ENST00000369977 5597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
NLRP1Q9C000 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NLRP1Q9C000 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
NLRP1Q9C000 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
NLRP1Q9C000 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
NLRP1Q9C000 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NLRP1Q9C000 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
NLRP1Q9C000 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NLRP1Q9C000 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
NLRP1Q9C000 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NLRP1Q9C000 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
NLRP1Q9C000 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NLRP1Q9C000 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
NLRP1Q9C000 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
NLRP1Q9C000 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
NLRP1Q9C000 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
NLRP1Q9C000 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
NLRP1Q9C000 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NLRP1Q9C000 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NLRP1Q9C000 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
NLRP1Q9C000 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NLRP1Q9C000 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NLRP1Q9C000 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
NLRP1Q9C000 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
NLRP1Q9C000 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
NLRP1Q9C000 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
NLRP1Q9C000 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
NLRP1Q9C000 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
NLRP1Q9C000 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NLRP1Q9C000 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
NLRP1Q9C000 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
NLRP1Q9C000 SORBS1-205ENST00000371227 7279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
NLRP1Q9C000 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
NLRP1Q9C000 UPF2-203ENST00000397053 5369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
NLRP1Q9C000 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
NLRP1Q9C000 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
NLRP1Q9C000 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
NLRP1Q9C000 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
NLRP1Q9C000 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
NLRP1Q9C000 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
NLRP1Q9C000 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
NLRP1Q9C000 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
NLRP1Q9C000 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
NLRP1Q9C000 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
NLRP1Q9C000 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
NLRP1Q9C000 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
NLRP1Q9C000 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
NLRP1Q9C000 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
NLRP1Q9C000 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
NLRP1Q9C000 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
NLRP1Q9C000 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
NLRP1Q9C000 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
NLRP1Q9C000 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
NLRP1Q9C000 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
NLRP1Q9C000 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
NLRP1Q9C000 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
NLRP1Q9C000 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
NLRP1Q9C000 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
NLRP1Q9C000 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
NLRP1Q9C000 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
NLRP1Q9C000 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
NLRP1Q9C000 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
NLRP1Q9C000 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
NLRP1Q9C000 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
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