Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC009743.1-201ENST00000415774 610 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 ETDB-201ENST00000423661 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 ETDB-202ENST00000426364 388 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 ETDA-201ENST00000427686 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AL139042.1-201ENST00000429137 305 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 HIGD1AP4-201ENST00000430194 280 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AL139002.1-201ENST00000435281 902 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 MYL6P3-201ENST00000436904 432 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC009518.3-201ENST00000438972 253 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AP006216.1-201ENST00000439104 419 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 ETDA-202ENST00000454551 388 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AKR1D1P1-201ENST00000457236 936 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 GAPDHP53-201ENST00000458397 924 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC239804.1-201ENST00000466343 869 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 RN7SL267P-201ENST00000485107 261 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 MEF2C-AS1-211ENST00000514092 501 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC096661.1-201ENST00000515870 822 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC087286.3-201ENST00000561409 953 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC018557.2-201ENST00000565082 536 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 RAB27A-212ENST00000569493 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC010531.4-201ENST00000570286 576 ntTSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC069366.1-201ENST00000583159 838 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 5S_rRNA.23-201ENST00000612086 102 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC244131.2-201ENST00000612592 512 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 MRPL57P1-201ENST00000621486 265 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 LINC00251-201ENST00000627569 1055 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 LINC01440-210ENST00000629744 541 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 GPR89A-203ENST00000462900 1527 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 GMFG-201ENST00000253054 616 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 OR1Q1-201ENST00000297913 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 IGKV3-7-201ENST00000390247 445 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 SPATA20P1-201ENST00000423089 438 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 TMEM196-204ENST00000433641 768 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 NFIA-AS2-203ENST00000438559 1275 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 AC027124.1-201ENST00000440852 466 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 MED28P7-201ENST00000456611 530 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 PTTG2-201ENST00000504686 691 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 USP17L23-201ENST00000506619 551 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 SNX18P23-201ENST00000510867 677 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 SCARNA11.1-201ENST00000516918 132 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 FBXO16-207ENST00000518734 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 CARSP2-201ENST00000520688 277 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.9 ms