Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 AC009137.2-201ENST00000568179 641 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 ARAFP1-201ENST00000422172 605 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 RCC2P2-201ENST00000422174 918 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 AC078906.1-201ENST00000523602 798 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 AC018557.2-201ENST00000565082 536 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 TMEM30CP-203ENST00000637814 1035 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 CR788268.1-201ENST00000603931 1809 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 AL603840.1-203ENST00000424357 645 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 SEPT7P6-201ENST00000469999 1143 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 B4GALT4-AS1-201ENST00000470790 544 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 AC078878.1-201ENST00000539832 958 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 NPM1P45-201ENST00000583151 559 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
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