Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AL353692.2-201ENST00000407054 335 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AC073486.1-202ENST00000458437 489 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 NCK1-AS1-201ENST00000461864 1194 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AC025181.1-201ENST00000477507 416 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 METTL15P1-201ENST00000481421 1045 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
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CCDC142Q17RM4 AC010531.5-201ENST00000602779 450 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
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CCDC142Q17RM4 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
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CCDC142Q17RM4 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
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CCDC142Q17RM4 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
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CCDC142Q17RM4 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 LINC01017-201ENST00000508823 768 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
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