Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 AC018680.1-201ENST00000513332 875 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CDKN3Q16667 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 UBE2V2P1-201ENST00000434717 398 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 SUMO2P1-206ENST00000445436 284 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AL133372.1-201ENST00000493565 745 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 MTND2P17-201ENST00000550281 688 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AP005212.4-201ENST00000614206 710 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AL356752.1-201ENST00000615844 593 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AC022535.1-201ENST00000420082 691 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 RPL7P61-201ENST00000451721 751 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 OR52Y1P-201ENST00000452418 828 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AC015864.1-201ENST00000496512 544 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 ETFRF1-202ENST00000553788 708 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
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