Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 SPINK9-202ENST00000511717 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AP003501.1-201ENST00000524453 744 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AC093524.1-201ENST00000564266 1094 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 FAM49B-229ENST00000615041 750 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 BPIFC-201ENST00000300399 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 NAP1L4P3-201ENST00000432820 1147 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AL445307.1-201ENST00000446476 602 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 RPS26P41-201ENST00000450370 284 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AC020551.1-201ENST00000512036 539 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 NUCB2-220ENST00000622082 1369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 LINC00446-201ENST00000414743 459 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 NFYAP1-201ENST00000431953 972 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms