Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 AC117525.1-201ENST00000515228 503 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 NEDD8-203ENST00000524927 653 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 AC108865.2-201ENST00000606881 432 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 AC020763.5-201ENST00000623298 430 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 RNU2-18P-201ENST00000411224 162 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 CDY8P-201ENST00000428380 1279 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 AC062021.1-201ENST00000429008 557 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 DCN-205ENST00000441303 519 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 CDY20P-201ENST00000447528 1279 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 OR9N1P-201ENST00000491296 333 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 AC011405.1-202ENST00000504658 803 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 AC093763.1-201ENST00000512464 699 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 DEFB109F-202ENST00000542600 509 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 AC007333.2-201ENST00000569998 559 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 AC027281.1-201ENST00000574178 758 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 AC134669.1-201ENST00000581275 672 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 RBMS3-AS2-206ENST00000629296 438 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 OR51C1P-202ENST00000641159 1444 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 CXADRP1-201ENST00000398098 1095 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 RPL24P2-201ENST00000421023 475 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 MTCO1P51-201ENST00000427672 1060 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL3Q13618 HTR3E-AS1-201ENST00000431427 515 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
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