Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SP140Q13342 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SP140Q13342 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SP140Q13342 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SP140Q13342 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SP140Q13342 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SP140Q13342 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SP140Q13342 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SP140Q13342 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SP140Q13342 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SP140Q13342 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SP140Q13342 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SP140Q13342 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SP140Q13342 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SP140Q13342 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SP140Q13342 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
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SP140Q13342 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
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SP140Q13342 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
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SP140Q13342 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
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SP140Q13342 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
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SP140Q13342 SH2D1A-203ENST00000477673 461 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AC098818.1-201ENST00000478593 252 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
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SP140Q13342 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
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SP140Q13342 AC018557.2-201ENST00000565082 536 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
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SP140Q13342 AL357140.4-201ENST00000636827 412 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
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SP140Q13342 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
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SP140Q13342 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
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SP140Q13342 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SP140Q13342 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SP140Q13342 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SP140Q13342 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SP140Q13342 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SP140Q13342 KIF27-202ENST00000334204 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
SP140Q13342 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
SP140Q13342 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
SP140Q13342 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
SP140Q13342 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
SP140Q13342 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
SP140Q13342 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
SP140Q13342 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SP140Q13342 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SP140Q13342 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SP140Q13342 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SP140Q13342 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SP140Q13342 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SP140Q13342 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SP140Q13342 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SP140Q13342 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
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