Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 OR1L4-201ENST00000259466 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 AC145141.1-201ENST00000510180 567 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 AC109464.1-201ENST00000511091 819 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 AC011601.1-201ENST00000549710 577 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 AC023932.1-201ENST00000582726 429 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
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TRAF1Q13077 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
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TRAF1Q13077 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
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TRAF1Q13077 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
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TRAF1Q13077 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
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TRAF1Q13077 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
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TRAF1Q13077 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
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