Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 QRSL1P1-201ENST00000400977 1540 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 RN7SKP184-201ENST00000362348 333 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 NUDT5-203ENST00000378940 1126 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 MRPL35-203ENST00000409180 651 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 AL445224.1-201ENST00000420595 737 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 AL022324.2-201ENST00000434827 780 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 OR7L1P-201ENST00000456181 380 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 MTCYBP14-201ENST00000457471 715 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 NR1I3-229ENST00000511748 480 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 RNU4-18P-201ENST00000516751 149 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 AC025857.1-201ENST00000525252 377 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 AC007346.1-201ENST00000569208 867 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 AP000919.1-201ENST00000582850 985 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 C5orf63-208ENST00000607731 478 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 AC073389.3-201ENST00000609434 935 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 AC015819.1-201ENST00000613588 663 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 UEVLD-202ENST00000320750 1799 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 DDX4-211ENST00000511853 1984 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 OR7E25P-201ENST00000344844 931 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 RNU1-65P-201ENST00000363919 148 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 AL133268.4-201ENST00000424868 472 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 AL513348.1-201ENST00000435554 440 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 AC095033.1-201ENST00000451611 1096 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 TTC26-205ENST00000474035 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 AC097534.1-201ENST00000507803 521 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 AC040934.1-201ENST00000523101 513 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 AC013652.2-202ENST00000558948 910 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 TTC39C-AS1-201ENST00000579713 817 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 MIR6885-201ENST00000612241 66 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 OSTC-205ENST00000613215 876 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP1Q12981 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
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