Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 OR5M12P-201ENST00000423388 929 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 RPL31P15-201ENST00000449770 338 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC130404.1-201ENST00000539362 739 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 RORA-203ENST00000335670 10844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
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FOXF2Q12947 ZNF532-214ENST00000589288 5585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 MDGA2-201ENST00000357362 2965 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 MUC5B-204ENST00000529681 17911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 BTN3A2-203ENST00000396934 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 OR2T7-201ENST00000641057 3463 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
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FOXF2Q12947 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
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FOXF2Q12947 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 ZNF528-203ENST00000391788 4209 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
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FOXF2Q12947 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 OR2T5-201ENST00000641363 2525 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 CDKAL1-202ENST00000378610 3115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 SLC26A5-205ENST00000393723 2174 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
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