Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 RPS19P6-201ENST00000441327 433 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AF196972.1-201ENST00000445586 653 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 GOT2P2-201ENST00000450663 1251 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 SRP68P2-201ENST00000456184 254 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 EIF3LP2-201ENST00000457262 807 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AL356364.1-201ENST00000458443 182 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 C2orf74-204ENST00000464909 726 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 RN7SL149P-201ENST00000465197 281 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AF305872.1-201ENST00000485217 471 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 RN7SL518P-201ENST00000491887 280 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 IGLC4-201ENST00000517690 248 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AP001007.2-201ENST00000525429 593 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 SLC25A51P2-201ENST00000535708 889 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC022509.1-203ENST00000541940 708 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 EEF1A1P17-201ENST00000547505 1275 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AL157871.4-201ENST00000557226 385 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 IQCK-206ENST00000564186 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AP001122.1-201ENST00000572256 541 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC008551.1-201ENST00000575612 405 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC015908.3-202ENST00000579367 457 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 CLK4-214ENST00000611575 1206 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 ALKAL2-208ENST00000619265 496 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 OR1N1-202ENST00000619659 939 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 FAM13A-AS1-201ENST00000500765 3210 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 ZNF121-202ENST00000586602 7177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 RACGAP1P-201ENST00000550663 1879 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 IL5RA-209ENST00000446632 2514 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 IARS-202ENST00000375643 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 MOB4-201ENST00000233892 3785 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 CD209-203ENST00000315599 4283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 USP16-203ENST00000399975 2960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 TC2N-202ENST00000360594 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC079949.2-201ENST00000617117 2933 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 DHRS9-204ENST00000428522 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 OR51M1-201ENST00000328611 1058 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 S100A1-202ENST00000368696 522 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 FABP3-201ENST00000373713 725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 TRAV12-3-201ENST00000390442 399 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 NPPA-AS1-201ENST00000400892 936 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 TIMD4-203ENST00000407087 1145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 RN7SKP137-201ENST00000411074 307 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AL662791.3-201ENST00000413771 776 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC073115.2-201ENST00000416708 555 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 OR13C7-201ENST00000424348 959 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AL669831.5-205ENST00000429505 441 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 KCTD9P1-201ENST00000430462 1167 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 CRYGGP-201ENST00000443337 145 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AL354714.5-201ENST00000450131 590 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 RN7SL561P-201ENST00000488553 281 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AP004607.5-201ENST00000532034 217 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 PDCL3P1-201ENST00000534575 734 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC021979.2-201ENST00000553644 209 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC020978.2-201ENST00000563203 428 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.2 ms