Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TTPAP49638 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TTPAP49638 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TTPAP49638 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TTPAP49638 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TTPAP49638 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TTPAP49638 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TTPAP49638 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TTPAP49638 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TTPAP49638 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TTPAP49638 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TTPAP49638 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TTPAP49638 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TTPAP49638 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TTPAP49638 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TTPAP49638 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TTPAP49638 CASP5-203ENST00000418434 1023 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TTPAP49638 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TTPAP49638 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TTPAP49638 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TTPAP49638 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TTPAP49638 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TTPAP49638 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TTPAP49638 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TTPAP49638 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TTPAP49638 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TTPAP49638 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TTPAP49638 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TTPAP49638 ASB8-215ENST00000540782 659 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TTPAP49638 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TTPAP49638 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TTPAP49638 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TTPAP49638 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TTPAP49638 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TTPAP49638 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TTPAP49638 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TTPAP49638 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TTPAP49638 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TTPAP49638 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TTPAP49638 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TTPAP49638 NR1H5P-201ENST00000452683 1377 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TTPAP49638 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TTPAP49638 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TTPAP49638 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TTPAP49638 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TTPAP49638 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TTPAP49638 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TTPAP49638 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TTPAP49638 OR1L4-201ENST00000259466 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TTPAP49638 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TTPAP49638 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TTPAP49638 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TTPAP49638 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TTPAP49638 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TTPAP49638 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TTPAP49638 LINC01762-201ENST00000423907 454 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TTPAP49638 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TTPAP49638 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TTPAP49638 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TTPAP49638 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TTPAP49638 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TTPAP49638 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TTPAP49638 IQCJ-SCHIP1-AS1-201ENST00000460574 508 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TTPAP49638 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TTPAP49638 AC015864.1-201ENST00000496512 544 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TTPAP49638 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TTPAP49638 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TTPAP49638 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TTPAP49638 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TTPAP49638 RERGL-203ENST00000538724 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TTPAP49638 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TTPAP49638 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TTPAP49638 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TTPAP49638 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TTPAP49638 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TTPAP49638 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TTPAP49638 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TTPAP49638 AP005131.7-201ENST00000610087 611 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TTPAP49638 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TTPAP49638 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TTPAP49638 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TTPAP49638 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TTPAP49638 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TTPAP49638 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TTPAP49638 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TTPAP49638 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TTPAP49638 AC099654.3-201ENST00000447087 1546 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TTPAP49638 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TTPAP49638 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
TTPAP49638 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
TTPAP49638 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
TTPAP49638 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TTPAP49638 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TTPAP49638 VNN3-203ENST00000392393 1603 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
TTPAP49638 STX19-201ENST00000315099 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
TTPAP49638 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TTPAP49638 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TTPAP49638 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TTPAP49638 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TTPAP49638 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms