Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 RPS26P41-201ENST00000450370 284 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 CREM-228ENST00000473940 1182 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AC124854.1-201ENST00000512210 511 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 LINC02505-203ENST00000515128 756 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AC026462.4-201ENST00000565229 951 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AC007333.2-201ENST00000569998 559 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 ASNSD1-209ENST00000607829 581 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AC074276.2-201ENST00000619891 348 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AL355860.1-201ENST00000636087 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 TCEAL7-201ENST00000332431 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
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HOXD13P35453 AC009506.2-201ENST00000420635 840 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
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HOXD13P35453 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
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HOXD13P35453 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AC023932.1-201ENST00000582726 429 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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