Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 SULT1C3-201ENST00000329106 915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 AC009965.1-201ENST00000411436 570 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 SEPT7P8-201ENST00000413308 775 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 AL513348.1-201ENST00000435554 440 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 SNURF-202ENST00000577949 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 BPIFA4P-204ENST00000605211 656 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 PA2G4P1-201ENST00000442248 1197 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 AL049544.1-201ENST00000511849 673 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 TPT1-AS1-209ENST00000520585 818 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 AP000755.1-201ENST00000527100 507 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 AC005833.3-202ENST00000544741 770 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 RN7SL657P-201ENST00000582431 293 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 AC087468.1-201ENST00000604365 630 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 AC012511.1-201ENST00000608140 449 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 CCT6B-203ENST00000436961 1639 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 RNU1-65P-201ENST00000363919 148 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 ARPP21-AS1-201ENST00000415706 542 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 AL022324.2-201ENST00000434827 780 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 AC108066.1-201ENST00000437261 596 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CASQ1P31415 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.6 ms