Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 Z99916.1-201ENST00000454253 482 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 AC145141.1-201ENST00000510180 567 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 OR4A46P-201ENST00000527255 933 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 AC009063.2-203ENST00000567860 745 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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HOXA13P31271 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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HOXA13P31271 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
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HOXA13P31271 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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HOXA13P31271 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXA13P31271 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
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