Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 BRD8-204ENST00000411594 2967 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 HEPH-209ENST00000519389 6013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 TTTY4B-201ENST00000420149 1346 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 TTTY4-201ENST00000436568 1346 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 TTTY4C-201ENST00000456123 1346 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 OR2AH1P-202ENST00000641232 2744 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AL160408.3-201ENST00000442382 3564 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 SLC2A14-201ENST00000340749 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AADACL3-201ENST00000359318 3662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 BMX-201ENST00000342014 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 LINC01620-202ENST00000372910 649 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AL050335.1-201ENST00000396909 869 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 RNU4ATAC2P-201ENST00000408674 126 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC017035.1-201ENST00000411999 1115 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 BX284668.3-201ENST00000414128 882 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC009227.2-201ENST00000432599 511 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 MORF4L1P5-201ENST00000433352 961 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 LINC01918-202ENST00000438148 415 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC131392.1-201ENST00000506490 633 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC145350.2-201ENST00000561541 821 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC002519.2-203ENST00000567043 837 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC011120.1-201ENST00000583916 624 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 LINC01435-212ENST00000601212 742 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 LINC00836-201ENST00000625325 582 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 CDH17-203ENST00000450165 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 ENO1P4-201ENST00000416471 1785 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 ERVW-1-202ENST00000603053 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 SELP-203ENST00000367788 2427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 SCRN1-202ENST00000409497 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 CLNK-204ENST00000515667 4180 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 ZNF407-203ENST00000577538 5794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 PPP2R3A-202ENST00000334546 2196 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 NXF2B-202ENST00000602195 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 NXF2-202ENST00000625106 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 ROBO1-202ENST00000464233 6742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 LRP2BP-203ENST00000510776 3055 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 EPB41L2-209ENST00000525193 2121 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 EEF1A1P12-201ENST00000443590 1346 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 THADA-204ENST00000403856 6939 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 APOL3-203ENST00000397287 3626 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 OR2AG2-202ENST00000641124 4224 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 OR2AG2-203ENST00000641169 4221 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 MROH9-201ENST00000367758 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 LIMCH1-201ENST00000313860 6165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 BMPR2-202ENST00000374580 11461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 LINC00282-202ENST00000627246 4008 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 OR2A42-202ENST00000641810 4946 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 CACNA1D-211ENST00000636570 6441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 FASLG-201ENST00000340030 917 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AL035401.1-201ENST00000420572 871 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC079807.1-201ENST00000429993 481 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 CLYBL-AS2-201ENST00000430125 695 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
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