Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CNTN3Q9P232 AL390198.2-201ENST00000510553 222 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
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CNTN3Q9P232 OR52H2P-201ENST00000514607 902 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 BCAS2P1-201ENST00000528022 632 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
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