Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AL161804.1-201ENST00000555600 708 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AC092902.2-219ENST00000608488 822 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AL356752.1-201ENST00000615844 593 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 ADAMTS9-AS1-210ENST00000625328 699 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AC034205.1-201ENST00000520621 638 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AC104257.1-202ENST00000524275 884 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 BNIP3P32-201ENST00000600015 554 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CIPCQ9C0C6 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
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