Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AL158819.1-201ENST00000514681 398 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC022778.1-201ENST00000518302 545 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 LYNX1-207ENST00000523332 600 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 SLC5A4P1-201ENST00000532944 612 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 BRWD1P2-201ENST00000546823 340 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC023511.1-201ENST00000549055 571 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC026464.1-202ENST00000564737 722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC130651.2-201ENST00000573856 536 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 ACP5-208ENST00000590420 301 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 HOTTIP_2.1-201ENST00000616633 376 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 NELFE-214ENST00000625905 111 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC007241.1-201ENST00000634531 933 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 PPP3CA-205ENST00000507176 1958 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC004014.2-201ENST00000623718 5122 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC126755.2-201ENST00000545114 1522 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 HPS5-205ENST00000438420 4147 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 MME-203ENST00000460393 5622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 CARF-202ENST00000402905 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 NXPE3-207ENST00000616286 1832 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 RBBP4-202ENST00000373493 7943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 NRG1-209ENST00000519301 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 SOX6-201ENST00000316399 8808 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
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ANKRD39Q53RE8 EOGT-201ENST00000295571 4138 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 ZNF20-201ENST00000334213 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
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ANKRD39Q53RE8 NBPF9-205ENST00000613595 4527 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 KIAA1958-203ENST00000536272 7650 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
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ANKRD39Q53RE8 SNORD46-201ENST00000364043 104 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
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ANKRD39Q53RE8 CCR8-202ENST00000414803 1078 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 LINC00403-201ENST00000421423 545 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
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ANKRD39Q53RE8 FUNDC2P4-201ENST00000441207 421 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 ATP5J2LP-201ENST00000444161 235 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
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ANKRD39Q53RE8 AL583808.1-201ENST00000445976 499 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
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ANKRD39Q53RE8 AL365436.1-201ENST00000452587 495 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC092159.1-202ENST00000456255 389 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC124861.1-201ENST00000457178 429 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AL031727.1-201ENST00000457263 455 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC104212.1-201ENST00000472088 613 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC009269.1-202ENST00000484381 469 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 RN7SL632P-201ENST00000489734 266 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC002384.1-201ENST00000490162 429 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 LINC01948-201ENST00000506836 656 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AF186996.3-201ENST00000509527 964 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC084357.2-201ENST00000509615 275 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC079238.1-201ENST00000509840 1009 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
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