Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 GABARAPL3-201ENST00000412799 354 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 CASKP1-201ENST00000412870 582 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 HMGB1P32-201ENST00000425971 565 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC111000.5-201ENST00000506559 1178 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 DCTN5-207ENST00000568272 523 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AL157392.3-211ENST00000599378 509 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 OR4K13-201ENST00000315693 915 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC074367.1-201ENST00000438685 1125 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 USP9YP5-201ENST00000511770 630 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108 ms