Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
USF2Q15853 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
USF2Q15853 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
USF2Q15853 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
USF2Q15853 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
USF2Q15853 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
USF2Q15853 IGLV3-10-201ENST00000390315 382 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
USF2Q15853 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
USF2Q15853 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
USF2Q15853 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
USF2Q15853 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
USF2Q15853 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
USF2Q15853 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
USF2Q15853 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AL121917.1-201ENST00000441270 893 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
USF2Q15853 EEF1B2P3-201ENST00000447718 678 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
USF2Q15853 TAAR4P-201ENST00000454843 1039 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
USF2Q15853 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
USF2Q15853 RN7SKP70-201ENST00000516655 271 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
USF2Q15853 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AC002519.2-203ENST00000567043 837 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
USF2Q15853 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
USF2Q15853 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
USF2Q15853 MIR3154-201ENST00000577829 84 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
USF2Q15853 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
USF2Q15853 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
USF2Q15853 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
USF2Q15853 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
USF2Q15853 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
USF2Q15853 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
USF2Q15853 CASC19-274ENST00000642018 970 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
USF2Q15853 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
USF2Q15853 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
USF2Q15853 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
USF2Q15853 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
USF2Q15853 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
USF2Q15853 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
USF2Q15853 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
USF2Q15853 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
USF2Q15853 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
USF2Q15853 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
USF2Q15853 HCFC2P1-201ENST00000392864 1592 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
USF2Q15853 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
USF2Q15853 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
USF2Q15853 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
USF2Q15853 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
USF2Q15853 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
USF2Q15853 LINC01568-202ENST00000555721 1325 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
USF2Q15853 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
USF2Q15853 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
USF2Q15853 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
USF2Q15853 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
USF2Q15853 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
USF2Q15853 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
USF2Q15853 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
USF2Q15853 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
USF2Q15853 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
USF2Q15853 VN1R12P-201ENST00000403778 876 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
USF2Q15853 RN7SKP86-201ENST00000410454 332 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
USF2Q15853 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
USF2Q15853 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
USF2Q15853 VN1R21P-201ENST00000426703 765 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
USF2Q15853 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
USF2Q15853 RPL6P30-201ENST00000443382 862 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
USF2Q15853 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
USF2Q15853 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AC093166.3-201ENST00000448785 303 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
USF2Q15853 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
USF2Q15853 LINC01487-201ENST00000462531 905 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AC008413.2-201ENST00000507398 342 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
USF2Q15853 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
USF2Q15853 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
USF2Q15853 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
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