Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 RNA5SP116-201ENST00000516132 98 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 AP005436.3-201ENST00000532849 572 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 AL049840.6-202ENST00000603373 279 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 NHS-202ENST00000398097 8213 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 ALPK2-201ENST00000361673 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 PLA2R1-201ENST00000283243 14371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 SMCO1-201ENST00000397537 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 IFNG-AS1-202ENST00000538665 1791 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 ZNF573-202ENST00000357309 2124 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
PTCH1Q13635 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 DCHS2-207ENST00000623607 8912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 DNAJC15-201ENST00000379221 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 AC007064.3-201ENST00000422608 359 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 LINC02218-202ENST00000504998 582 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 AC015726.1-202ENST00000602532 475 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 LINC00282-202ENST00000627246 4008 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 AK3-201ENST00000359883 1536 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 RORA-203ENST00000335670 10844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 SCN1A-204ENST00000423058 8191 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 PHLDB2-211ENST00000481953 5474 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms