Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 IGKV2-4-201ENST00000523070 340 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 CR383656.14-201ENST00000551951 406 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AC027176.2-201ENST00000559166 746 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AC007639.1-201ENST00000577281 833 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AC005726.4-201ENST00000582858 458 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AL365181.4-201ENST00000609800 547 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 LINC02033-201ENST00000623207 971 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AC079298.2-201ENST00000623885 459 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AC003991.1-210ENST00000434733 1048 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AC106806.2-201ENST00000509365 500 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 CCDC60-203ENST00000536742 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AL157938.2-208ENST00000590461 877 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AC079315.1-201ENST00000602952 623 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AL139220.2-221ENST00000628123 395 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AP001002.1-201ENST00000625148 1513 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 OR56A4-201ENST00000330728 1209 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL4BQ13620 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
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