Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NME3Q13232 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NME3Q13232 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NME3Q13232 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NME3Q13232 DEFB109A-201ENST00000482450 265 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NME3Q13232 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AC004052.1-201ENST00000514327 567 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NME3Q13232 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NME3Q13232 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NME3Q13232 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NME3Q13232 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NME3Q13232 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NME3Q13232 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NME3Q13232 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NME3Q13232 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NME3Q13232 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NME3Q13232 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NME3Q13232 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NME3Q13232 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NME3Q13232 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NME3Q13232 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NME3Q13232 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NME3Q13232 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NME3Q13232 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NME3Q13232 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NME3Q13232 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NME3Q13232 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NME3Q13232 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NME3Q13232 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NME3Q13232 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AC093827.1-201ENST00000480094 861 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NME3Q13232 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NME3Q13232 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NME3Q13232 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NME3Q13232 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NME3Q13232 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AP005212.4-201ENST00000614206 710 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NME3Q13232 LINC02246-206ENST00000630211 712 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NME3Q13232 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NME3Q13232 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NME3Q13232 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NME3Q13232 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NME3Q13232 LINC02352-202ENST00000559292 1450 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NME3Q13232 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NME3Q13232 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NME3Q13232 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NME3Q13232 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NME3Q13232 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NME3Q13232 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NME3Q13232 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NME3Q13232 PLSCR2-201ENST00000336685 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NME3Q13232 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NME3Q13232 CASP5-203ENST00000418434 1023 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AC092941.2-201ENST00000444379 1008 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NME3Q13232 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NME3Q13232 SEC22A-207ENST00000481965 673 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NME3Q13232 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NME3Q13232 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NME3Q13232 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NME3Q13232 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NME3Q13232 MS4A3-208ENST00000534744 507 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NME3Q13232 ASB8-215ENST00000540782 659 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AC015727.1-201ENST00000572792 512 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NME3Q13232 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NME3Q13232 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NME3Q13232 WBP1LP8-201ENST00000617401 327 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NME3Q13232 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NME3Q13232 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NME3Q13232 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.5 ms