Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 AC004808.2-201ENST00000627965 773 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
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FOXF1Q12946 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 BPIFC-201ENST00000300399 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
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FOXF1Q12946 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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FOXF1Q12946 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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FOXF1Q12946 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
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FOXF1Q12946 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXF1Q12946 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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