Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 ETS1-202ENST00000392668 5139 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 SLC6A14-202ENST00000598581 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 NOSTRIN-202ENST00000397206 1446 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 CDON-202ENST00000392693 9138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 RIPOR2-208ENST00000613507 5539 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 GRIK2-207ENST00000421544 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 CPEB4-201ENST00000265085 9483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 DOCK8-204ENST00000432829 7452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 CNR1-202ENST00000369499 5549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 ZBTB25-204ENST00000608382 10372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 DCAF10-201ENST00000242323 7393 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 SLF1-201ENST00000265140 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 CREB5-201ENST00000357727 8532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 LINC00632-204ENST00000602830 597 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 MPP7-203ENST00000375732 5063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 UTP14C-201ENST00000521776 5529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 DOCK11-201ENST00000276202 6625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 HYDIN2-203ENST00000614586 13885 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 NFAT5-202ENST00000354436 13229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 MAP4K4-219ENST00000625522 7458 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 AC015726.1-202ENST00000602532 475 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 PPFIA2-216ENST00000549396 5363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 ATOX1-203ENST00000521264 4341 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 CTNND1-201ENST00000358694 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
BPTFQ12830 RBM23-203ENST00000359890 10040 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
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