Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 AL512882.1-201ENST00000436086 832 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
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HOXD11P31277 COTL1P2-201ENST00000455360 352 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 RN7SL361P-201ENST00000470785 298 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 RN7SL108P-201ENST00000481903 297 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 AC092435.1-201ENST00000513711 443 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
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HOXD11P31277 AC018448.2-201ENST00000548295 305 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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HOXD11P31277 AC091180.2-203ENST00000507337 601 ntTSL 4 BASIC9.87□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 RNA5SP422-201ENST00000516778 111 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 AC023403.1-202ENST00000521139 759 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 AL133297.1-201ENST00000568149 404 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 BSNDP1-201ENST00000613026 367 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 EDRF1-AS1-214ENST00000622798 526 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 AC092135.2-201ENST00000624702 506 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
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