Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

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Length 1,248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
APAF1O14727 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
APAF1O14727 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
APAF1O14727 AC079630.1-201ENST00000412812 585 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
APAF1O14727 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
APAF1O14727 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
APAF1O14727 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
APAF1O14727 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
APAF1O14727 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
APAF1O14727 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
APAF1O14727 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
APAF1O14727 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
APAF1O14727 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
APAF1O14727 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
APAF1O14727 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
APAF1O14727 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
APAF1O14727 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
APAF1O14727 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
APAF1O14727 OR10D4P-201ENST00000525892 951 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
APAF1O14727 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
APAF1O14727 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
APAF1O14727 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
APAF1O14727 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
APAF1O14727 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
APAF1O14727 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
APAF1O14727 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
APAF1O14727 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
APAF1O14727 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
APAF1O14727 AL356490.1-201ENST00000623079 479 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
APAF1O14727 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
APAF1O14727 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
APAF1O14727 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
APAF1O14727 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
APAF1O14727 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
APAF1O14727 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
APAF1O14727 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
APAF1O14727 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
APAF1O14727 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
APAF1O14727 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
APAF1O14727 SATL1-202ENST00000509231 2224 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
APAF1O14727 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
APAF1O14727 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
APAF1O14727 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
APAF1O14727 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
APAF1O14727 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
APAF1O14727 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
APAF1O14727 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
APAF1O14727 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
APAF1O14727 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
APAF1O14727 SEPT7P8-201ENST00000413308 775 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
APAF1O14727 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
APAF1O14727 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
APAF1O14727 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
APAF1O14727 AP003774.2-202ENST00000449694 341 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
APAF1O14727 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
APAF1O14727 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
APAF1O14727 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
APAF1O14727 RPL37AP8-201ENST00000494116 276 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
APAF1O14727 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
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APAF1O14727 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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APAF1O14727 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
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APAF1O14727 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
APAF1O14727 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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APAF1O14727 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
APAF1O14727 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
APAF1O14727 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
APAF1O14727 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
APAF1O14727 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
APAF1O14727 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
APAF1O14727 NACAP7-201ENST00000407371 609 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
APAF1O14727 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
APAF1O14727 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
APAF1O14727 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
APAF1O14727 AC005008.2-201ENST00000431501 715 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
APAF1O14727 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
APAF1O14727 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
APAF1O14727 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
APAF1O14727 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
APAF1O14727 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
APAF1O14727 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
APAF1O14727 STRADBP1-201ENST00000478954 1281 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
APAF1O14727 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
APAF1O14727 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
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