Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 IQCM-206ENST00000636793 1900 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 TRAV35-201ENST00000390462 330 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009506.2-201ENST00000420635 840 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 SPINK9-202ENST00000511717 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AP005212.4-201ENST00000614206 710 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 NUCB2-220ENST00000622082 1369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 BPIFC-201ENST00000300399 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 CLECL1-201ENST00000327839 670 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC022826.2-201ENST00000358757 776 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AL136979.1-201ENST00000421645 1120 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.5 ms